Livros: - _Lembranças de uma visita às Filipinas no ano de 1853_ (1853)
- _O arquipélago malaio:a terra do orangotango e a ave do paraíso. Uma narrativa de viagem, 1848-1862_ (2 vols., 1869)
- _Jornal e Procedimentos no Estreito da Coreia_ (1869)
- _Bornéu e o Arquipélago Indiano_ (1870)
- _As Viagens e Aventuras de Fernão Mendez Pinto, o Português_ (1880)
- _Velha Penang_ (1911)
- _A História do Arquipélago Indiano_ (1911)
- _Narrativa da missão do conde de Elgin à China e ao Japão nos anos de 1857, '58, '59_ (1912)
- _Reminiscências de viagens no Extremo Oriente_ (1913)
Artigos: - "Avisos de Gramática Chinesa" (_O Repositório Chinês_, 1847)
- "Etiqueta e Costumes Chineses" (_O Repositório Chinês_, 1847)
- "A Religião da China" (_O Repositório Chinês_, 1847)
- "As piratarias malaias" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1847)
- "Avisos do Arquipélago Indiano e Etnologia Malaia" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1850)
- "Os chineses em Bornéu" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1850)
- "Os Bataks de Sumatra" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1851)
- "Algum relato dos Banting Muruts" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1852)
- "Os Pássaros do Arquipélago Malaio" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1852)
- "Os Mamíferos do Arquipélago Malaio" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1853)
- "Os Répteis do Arquipélago Malaio" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1853)
- "Os Peixes do Arquipélago Malaio" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1853)
- "Os Insetos do Arquipélago Malaio" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1853)
- "As Plantas do Arquipélago Malaio" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1854)
- "A Geologia do Arquipélago Malaio" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1855)
- "O Clima do Arquipélago Malaio" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1856)
- "A Geografia Física do Arquipélago Malaio" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1857)
- "A Etnologia do Arquipélago Malaio" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1858)
- "A História do Arquipélago Malaio" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1859)
- "A Literatura do Arquipélago Malaio" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1860)
- "As Artes e Ciências do Arquipélago Malaio" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1861)
- "O Comércio do Arquipélago Malaio" (_The Journal of the Indian Archipelago and Eastern Asia_, 1862)