Aqui estão todos os episódios do NCIS que foram ao ar em 2006:
Temporada 4: 1. Ofensa ao Capitólio (Episódio 1)
2. Escapar (Episódio 2)
3. Escolhido (Episódio 5)
4. Blowback (Episódio 6)
5. Amigos e Amantes (Episódio 7)
6. No Escuro (Episódio 11)
7. Gelo (Episódio 13)
8. Mira (Episódio 15)
9. Irmã Torcida (Episódio 17)
10. Fumado (Episódio 18)
11. Impulsionado (Episódio 19)
12. Anjo da Morte (Episódio 20)
13. Liberado (Episódio 22)
14. Dia do Julgamento (Parte 1) (Episódio 24)
Temporada 5: 1. Dia do Julgamento (Parte 2) (Episódio 1)
2. Crise de Identidade (Episódio 2)
3. Salto de Fé (Episódio 3)
4. Segredo de Família (Episódio 4)
5. Ex-Arquivo (Episódio 6)
6. Recuo (Episódio 7)
7. Jurisdição (Episódio 10)
8. Dog Tags (Episódio 11)
9. Chamada de Julgamento (Episódio 13)
10. Assassinato 2.0 (Episódio 15)
11. Tribos (Episódio 16)
12. Piquetagem (Episódio 18)
13. Dia bissexto (episódio 19)
14. Réquiem (Episódio 22)
15. Canção do Cisne (Episódio 23)
16. Heartland (Episódio 24)